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在發(fā)展中求生存,不斷完善,以良好信譽和科學(xué)的管理促進企業(yè)迅速發(fā)展首頁-產(chǎn)品中心-貴陽丙二酰化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析
蛋白質(zhì)翻譯后修飾:蛋白質(zhì)翻譯后修飾 (Protein translational modifications,PTMs) 通過功能基團或蛋白質(zhì)的共價添加、調(diào)節(jié)亞基的蛋白水解切割或整個蛋白質(zhì)的降解來增加蛋白質(zhì)組的功能多樣性。這些修飾包括磷酸化、糖基化、泛素化、亞硝基化、甲基化、乙酰化、脂質(zhì)化和蛋白水解,幾乎影響正常細胞生物學(xué)和發(fā)病機制的所有方面。因此,識別和理解 PTM 在細胞生物學(xué)和疾病療理和預(yù)防的研究中至關(guān)重要。蛋白質(zhì)翻譯后修飾 (PTMs) 進一步促進了從基因組水平到蛋白質(zhì)組復(fù)雜性的增加。PTMs 是一種化學(xué)修飾,在功能蛋白質(zhì)組中發(fā)揮關(guān)鍵作用,因為它們調(diào)節(jié)活性、定位以及與其他細胞分子(如蛋白質(zhì)、核酸、脂質(zhì)和輔助因子)的相互作用。已知的蛋白質(zhì)翻譯后修飾種類有20多種。貴陽丙二酰化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析
蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)技術(shù)怎么確定位點?蛋白質(zhì)經(jīng)過酶解后利用凝集素(lectin)富集N-糖基化肽段,然后用N-糖酰胺酶(PNGase)在H218O中切除連接在天冬酰胺殘基(Asn)上的糖鏈。該處理致使Asn分子量增加2.9890Da。之后用高精度LC-MS質(zhì)譜儀檢測脫糖后的肽段,并通過MASCOT軟件檢索數(shù)據(jù)庫,確認脫糖后分子量與其理論分子量的變化以及糖基化修飾肽段的序列,從而確定該蛋白質(zhì)的N-糖基化位點。琥珀酰化修飾蛋白質(zhì)組技術(shù)特點:采用主流抗體親和富集方法,特異性高,富集效率好。貴陽丙二酰化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析蛋白質(zhì)磷酸化修飾可應(yīng)用于食品工業(yè)方面。
乙酰化修飾蛋白組學(xué)實驗流程:1)組織/細胞破碎,提取蛋白質(zhì);2)蛋白酶解成多肽片段;3)對多肽片段進行 iTRAQ 標記;4)高效特異性乙酰化抗體富集乙酰化修飾肽段;5)使用 LC-MS/MS 對富集的乙酰化肽段進行序列分析;5)數(shù)據(jù)分析,比對不同樣本中蛋白乙酰化修飾水平差異,并對產(chǎn)生變化的生物學(xué)意義進行解釋。乙酰化是一個普遍而重要的蛋白質(zhì)翻譯后修飾,不僅集中在對細胞染色體結(jié)構(gòu)的影響以及對核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子方面,而且還影響參與細胞周期和新陳代謝、肌動蛋白聚合控制及多聚谷氨酰胺疾病等方方面面。乙酰化不僅存在于真核細胞中,而且越來越多的證據(jù)也表明乙酰化同樣影響許多原核細胞的生理生化過程。
泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)原理:盡管質(zhì)譜儀器的分析能力近年來有了長足的發(fā)展,但是由于蛋白翻譯后修飾化學(xué)計量值低、復(fù)雜性大,直接將蛋白組(如全細胞裂解產(chǎn)物,組織勻漿產(chǎn)物或全血清蛋白)的酶解肽段送入質(zhì)譜鑒定和定量PTM是非常困難的。因此,很多翻譯后修飾的富集方法會被采用,來提高樣品中PTM肽段的豐度和相對比例,從而提高了質(zhì)譜對翻譯后修飾位點的鑒定效率。研究發(fā)現(xiàn)在泛素化修飾的蛋白在tyrpsin的作用下都會產(chǎn)生diGly位點。基于這一特異性,利用針對蛋白質(zhì)翻譯后修飾(PTM)基序(motif)抗體,在肽段水平上免疫親和富集帶有泛素化修飾的肽段,利用液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜(LC-MS/MS)進行定量分析,能夠快速、準確、高通量地分析多種疾病相關(guān)信號通路關(guān)鍵節(jié)點蛋白修飾的變化,滿足創(chuàng)新性研究、生物標志物鑒定、藥物靶點篩選和評價的需求。蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)在細胞生物學(xué)以及疾病診斷和預(yù)防研究中至關(guān)重要。
泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué):泛素是一種由76個氨基酸組成的多肽,在真核生物中高度保守,可通過異肽鍵與目標蛋白賴氨酸殘基的氨基進行共價連接。泛素化蛋白的富集主要基于標記,泛素用親和標簽(通常為6xHis)進行標記,并通過鎳螯合色譜親和提取泛素化蛋白。由于泛素的C端為Arg-Gly-Gly結(jié)構(gòu),經(jīng)胰蛋白酶水解后,Gly-Gly保留在修飾蛋白的肽鏈上,使肽的質(zhì)量增加114,因此可作為泛素定位位點的質(zhì)量標記。用HPLC對樣品進行預(yù)分離,使用針對特定殘留結(jié)構(gòu)的抗體富集泛素化肽,可很大程度上提高泛素化蛋白的濃度。串聯(lián)質(zhì)譜可以鑒定泛素化位點。大多數(shù)翻譯后修飾蛋白以低化學(xué)計量和豐度存在,這限制了在分析全細胞裂解液時對其的檢測。貴陽丙二酰化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析
蛋白質(zhì)的磷酸化修飾是生物體內(nèi)比較重要的共價修飾方式之一。貴陽丙二酰化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析
泛素化修飾蛋白質(zhì)組產(chǎn)品介紹:泛素化修飾(Ubiquitylation)是一種常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾,是指一個或多個泛素分子(Ubiquitin,由76個氨基酸組成的多肽)在一系列特殊的酶作用下,將細胞內(nèi)的蛋白質(zhì)分類,從中選出靶蛋白分子,并對靶蛋白進行特異性修飾的過程。 泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾,泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導(dǎo)了真核生物80%~85%的蛋白質(zhì)降解。除參與蛋白質(zhì)降解之外,泛素化修飾還參與了細胞周期、增殖、細胞凋亡、分化、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、基因表達、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)、信號傳遞、損傷修復(fù)、炎癥免疫等幾乎一切生命活動的調(diào)控。泛素化、心血管等疾病的發(fā)病密切相關(guān)。因此,作為近年來生物化學(xué)研究的一個重大成果,它已然成為研究、開發(fā)新藥物的新靶點。貴陽丙二酰化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析
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